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ChIRP实验

简要描述:

ChiRP(Chromatin Isolation by RNA Purification )是一种检测与RNA绑定的DNA和蛋白相互作用的方法。该方法是通过设计生物素或链霉亲和素探针,把目标RNA拉下来以后,与其共同作用的DNA染色体片段就会附在到磁珠上,最后通过qRT-PCR、测序、免疫印迹法和质谱分析等确定目的RNA、DNA和RNA结合蛋白(RBPs)。

更新时间:2020-05-14

ChiRP(Chromatin Isolation by RNA Purification )是一种检测与RNA绑定的DNA和蛋白相互作用的方法。该方法是通过设计生物素或链霉亲和素探针,把目标RNA拉下来以后,与其共同作用的DNA染色体片段就会附在到磁珠上,最后通过qRT-PCR、测序、免疫印迹法和质谱分析等确定目的RNA、DNA和RNA结合蛋白(RBPs)。

实验流程:

1.        ChIRP探针设计合成

2.        lncRNA复合物交联

3.        超声打断

4.        探针杂交

5.        DNA回收纯化

6.        测序分析。

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