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技术服务 抗体测序服务

发布时间:2020-05-14   点击次数:94次

艾柏森生物科技有限公司作为值得信赖的抗体研发服务供应商,拥有专业的技术团队,可为客户提供卓越的抗体测序服务。艾柏森生物打造的全新一代抗体测序平台,基于茑枪法与抗体数据库相结合的技术“Database Assisted Shotgun Sequencing”(DASS)技术,这项技术还适用于其他亚型和不同形式的抗体,如:IGM,荧光偶联抗体,固定化抗体,不同物种的抗体等。

 

等重氨基酸测序

与其它基于MS测序方法不同的是,我们可以分辨大多数等重氨基酸复合物

★ W可与GE、AD、SV区分

★ R可从GV中区别出来

★ Q可从GA、K中区别出来

★ N可从GG中区别出来

 

Database Assisted Shotgun Sequencing, DASS

Figure 1.Workflow of Service

 

运用DASS技术对V、J、C片段测序

 

  目前已有的一些数据库(如NCBI)虽包含抗体V、J、C片段序列,但是在抗体成熟的过程中,一个B细胞中的抗体基因要经过体细胞突变的过程才会产生高亲和力的成熟抗体。

  我们采用独特的计算方法,并能匹配相应物种的突变肽段,保证每条肽段都会被检测到,且每一个氨基酸位点都会生成20-7-条MS/MS光谱,对最难测序的proline和arginine的肽段也可实现测序。

 

Database Assisted Shotgun Sequencing, DASS

Figure 2.Sequence coverage is verified with the integrity of the combination of multipleLC-MS/MS datasets

 

CDR3区测序

  抗体轻链的CDR3去多由胚系基因编码,而重链的CDR3区则由D基因编码,D基因大部分区域由于受到核酸酶及末端转移酶等重组酶的作用而发生基因重排,导致抗体重链CDR区在数据库中无法进行同源对比,而只能对其进行de novo测序。高质量的质谱数据与高效率的数据挖掘算法的结合,使我们对抗体CDR3区域的解读更为有力,我们可以测得数据库中无同源序列的20kDa的蛋白质。

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